433. 最小基因变化
433. 最小基因变化
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LeetCode
题目
A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from 'A'
, 'C'
, 'G'
, and 'T'
.
Suppose we need to investigate a mutation from a gene string startGene
to a gene string endGene
where one mutation is defined as one single character changed in the gene string.
- For example,
"AACCGGTT" --> "AACCGGTA"
is one mutation.
There is also a gene bank bank
that records all the valid gene mutations. A gene must be in bank
to make it a valid gene string.
Given the two gene strings startGene
and endGene
and the gene bank bank
, return the minimum number of mutations needed to mutate fromstartGene
toendGene
. If there is no such a mutation, return -1
.
Note that the starting point is assumed to be valid, so it might not be included in the bank.
Example 1:
Input: startGene = "AACCGGTT", endGene = "AACCGGTA", bank = ["AACCGGTA"]
Output: 1
Example 2:
Input: startGene = "AACCGGTT", endGene = "AAACGGTA", bank = ["AACCGGTA","AACCGCTA","AAACGGTA"]
Output: 2
Constraints:
0 <= bank.length <= 10
startGene.length == endGene.length == bank[i].length == 8
startGene
,endGene
, andbank[i]
consist of only the characters['A', 'C', 'G', 'T']
.
题目大意
基因序列可以表示为一条由 8
个字符组成的字符串,其中每个字符都是 'A'
、'C'
、'G'
和 'T'
之一。
假设我们需要调查从基因序列 start
变为 end
所发生的基因变化。一次基因变化就意味着这个基因序列中的一个字符发生了变化。
例如,"AACCGGTT" --> "AACCGGTA"
就是一次基因变化。
另有一个基因库 bank
记录了所有有效的基因变化,只有基因库中的基因才是有效的基因序列。(变化后的基因必须位于基因库 bank
中)
给你两个基因序列 start
和 end
,以及一个基因库 bank
,请你找出并返回能够使 start
变化为 end
所需的最少变化次数。如果无法完成此基因变化,返回 -1
。
注意:起始基因序列 start
默认是有效的,但是它并不一定会出现在基因库中。
解题思路
这个问题可以视作是一个无权图的最短路径问题,每个基因序列是图中的节点,相邻节点是那些只相差一个字符的序列。要找最短路径,可以使用 广度优先搜索(BFS)。
- 将起始序列放入队列,同时设定一个集合用于记录已经访问过的基因序列,避免重复访问。
- 每次从队列中取出一个基因序列,尝试将其每个字符替换为
A
、C
、G
、T
,看看是否能得到一个新的有效序列(这个新序列需要在基因库中存在,且没有被访问过)。 - 如果某次得到的序列等于目标序列,直接返回当前的变化次数。
- 如果该序列有效且未访问,则将其加入队列,继续下一步的遍历。
- 如果队列为空但还未找到目标序列,返回
-1
,表示无法到达目标序列。
复杂度分析
- 时间复杂度:
O(M * N)
,其中M
是基因序列的长度(8),N
是基因库的大小。对于每个序列,都有 8 个位置可以变化,每个位置可以选择 3 种不同的字符,因此时间复杂度相对较低。 - 空间复杂度:
O(N)
。
代码
/**
* @param {string} startGene
* @param {string} endGene
* @param {string[]} bank
* @return {number}
*/
var minMutation = function (startGene, endGene, bank) {
let bankSet = new Set(bank); // 将bank转为set,查找更快
if (!bankSet.has(endGene)) return -1;
// 所有可能的字符
const gene = ['A', 'G', 'C', 'T'];
// BFS
let queue = [startGene],
visited = new Set([startGene]), // 记录已访问的基因序列
step = 0;
while (queue.length) {
const len = queue.length;
for (let i = 0; i < len; i++) {
const cur = queue.shift();
// 如果新的基因序列就是目标序列
if (cur == endGene) {
return step;
}
// 生成新的基因序列
for (let newGene of getAllMutation(cur)) {
// 如果新的基因序列在基因库中,且没有访问过
if (!visited.has(newGene) && bankSet.has(newGene)) {
queue.push(newGene);
visited.add(newGene);
}
}
}
step++;
}
return -1;
};
// 求出所有可能的基因突变结果
var getAllMutation = function (gene) {
let res = [],
chars = gene.split('');
for (let i = 0; i < chars.length; i++) {
const char = chars[i];
for (let newChar of ['A', 'G', 'C', 'T']) {
chars[i] = newChar;
res.push(chars.join(''));
}
chars[i] = char;
}
return res;
};
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